Berdasarkan situasi dan penempatan situasi Shenzhen, Kumpulan Metro Shenzhen terus memperkukuh pelbagai langkah pencegahan seperti pembasmian kuman dan pembersihan, pengukuran suhu di stesen, dan tunggangan nama sebenar untuk memastikan keselamatan penumpang. Pada masa ini, purata pembasmian kuman harian di kawasan awam di Shenzhen Metro melebihi 6 juta meter persegi.
Pada masa ini, 260 stesen di 10 laluan di bawah bidang kuasa Kumpulan Metro Perbandaran mengekalkan kerja pembersihan dan pembersihan yang komprehensif dan terperinci. Setiap hari, terdapat pasukan pembunuh yang berdedikasi untuk membunuh semua stesen, hab dan ruang komersial kereta bawah tanah pada kekerapan 1-3 jam. Antaranya, bagi kereta tren, apabila semua tren dalam laluan berpatah balik di terminal 10 laluan, akan ada seorang yang berdedikasi di dalam tren untuk membunuh, bagi memastikan setiap tren dalam keadaan bersih dan selamat sebelum membawa penumpang.
Stesen dan kereta api Metro Shenzhen juga akan terus menggunakan kaedah seperti merendam penapis udara segar dan menggantikan penapis udara bercampur untuk memastikan udara di dalam kereta api bawah tanah kekal tidak terhalang dan bersih. Di samping itu, Metro Shenzhen telah meletakkan 910 "baldi khas untuk topeng yang dibuang" di kawasan awam stesen dan kawasan komersial, dan mengatur untuk pakar pembersihan untuk mengumpul, mengangkut, dan membasmi kuman untuk menyelesaikan masalah pembuangan topeng oleh rakyat dengan berkesan dan mengekang penyebaran virus.
Menurut Metro Shenzhen, 260 stesen semasa di bawah bidang kuasanya masih menjalankan pemeriksaan suhu untuk semua penumpang yang masuk dan menaiki pesawat. Antaranya, Futian, Lapangan Terbang, Shenzhen North dan stesen aliran penumpang utama lain telah melaburkan sejumlah 412 peralatan pengukuran fizikal inframerah, yang secara automatik boleh mengesan suhu badan yang tidak normal. Penumpang perlu melaporkan kepada polis untuk mempercepatkan kecekapan penumpang memasuki stesen dan mengelakkan orang ramai.
Sejak 16 Februari 2020, rangkaian talian penuh Metro Shenzhen telah melaksanakan sepenuhnya sistem tunggangan nama sebenar. Penumpang yang memegang kad tiket nama sebenar seperti kod bas Shenzhen Metro's, kod bas Shenzhen Tong's, kad IC kewangan, dsb. boleh terus menaiki bas dalam quot&;tanpa kenalan" cara. Penumpang dengan kad tiket bukan nama sebenar seperti pas Shenzhen biasa, tiket kaunter, pas hari, dll., mesti mengimbas kod QR untuk melengkapkan pendaftaran nama sebenar sebelum memasuki stesen. Langkah ini membolehkan Metro Shenzhen mengurus maklumat perjalanan semua penumpang secara digital dan menjejaki laluan perjalanan kenalan rapat pesakit yang disyaki dengan cekap.
